如何正确使用基因/蛋白质的名称格式(大写与斜体的使用)

admin 1月前 56 0

1 一般规则

  • 在你的文章中使用大家都认可的基因/蛋白质的名称和符号(见下文)
  • 有时认可的基因/蛋白质的名称或符号已经不再有效。这种情况下,第一次提到的基因/蛋白质,需要先列出经批准的名称,然后再添加括号说明(以前被称为XXX)。例如,“我们使用抗POU5F1蛋白的抗体(以前称为OCT-4)...”。注意使用正确的符号,而不是以往的名称。

2 不同物种有不同的规则

1) 小鼠 / 大鼠 / 鸡
(1)一般命名规则(适用于小鼠,大鼠和鸡):

  • 基因的全名不用斜体,也不用希腊字母

例如:insulin-like growth factor 1(胰岛素样生长因子1)

  • 基因符号不用希腊字母和连字符,使用斜体,第一个字母大写,其余小写

例如:Igf1 (斜体)(胰岛素样生长因子1)

  • 蛋白质的名称和基因符号相同,但不用斜体,并全部大写

例如:IGF1

  • mRNA和cDNA的基因符号和规定的格式

例如: "... levels of Igf1 (italicized) mRNA increased when..."

  • 首次提到的突变等位基因应该详细列出

例如:Igf1tm1Arge/Igf1tm1Arge (italicized) is one of several knockout alleles of Igf1 (italicized)

  • 所有字母和数字用斜体,等位基因的符号(tm1Arge)要用上标
  • 经前面详细描述之后,敲除的纯合子可表示为Igf1-/- (所有字母均用斜体,并且- / -用上标);杂合子为Igf1 + / - 等。

(2) 对于这些命名规定的详细信息,请参阅:

  • (小鼠,大鼠,鸡)  http://www.informatics.jax.org/
  • (专门针对大鼠)  http://rgd.mcw.edu/
  • MGI命名:http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/index.shtml
  • 基因的MGI快速指南:http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/short_gene.shtml

(3) 人类/非人类灵长类动物/家畜/ 除了小鼠、大鼠、鱼、昆虫、苍蝇外默认的其他物种

  • 完整的基因名称不用斜体和希腊字母

例如:insulin-like growth factor 1(胰岛素样生长因子1)

  • 基因符号不使用希腊字母和连字符,基因符号用斜体,所有的字母用大写

例如:IGF1(斜体)

  • 蛋白质的名称与基因符号相同,但不用斜体,并全部大写

例如:IGF1

  • mRNA和cDNA的基因符号和规定的格式

例如:"... levels of  IGF1 (italicized) mRNA increased when..."

更多关于此类物种基因(突变的等位基因)命名规则和符号的网站: http://www.genenames.org

(4) 鱼(适用于所有的鱼)

  • 完整的基因名称用斜体表示,全部用小写字母,不要用希腊字母

例如:cyclops(斜体)

  • 基因符号用斜体,全部小写

例如:cyc(斜体)

  • 蛋白质命名与基因符号相同,但仅首字母大写,也不用斜体

例如:Cyc

更多关于此类物种基因(突变的等位基因)命名规则和符号的网站: http://zfin.org/cgi-bin/webdriver?MIval=aa-ZDB_home.apg

(5) 其他有用的网站:

  • ExPASy(特殊蛋白质分析系统):是瑞士生物信息学研究所(SIB)提供的蛋白质组学服务系统,可对蛋白质序列和结构以及二维PAGE进行分析:(http://au.expasy.org /)
  • OMIM -孟德尔人类遗传学数据库: (www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=OMIM)
  • NCBI – Entrez Gene:提供了一个按序列和/或在NCBI's Map Viewer中查询基因的统一环境。您可以查询名称,符号,加入,出版物,GO条款,染色体数目,EC号码,和许多其他相关基因及它们的编码产物。 (www.ncbi.nlm.nih.gov/gene)

来源:www.letpub.com.cn/index.php?page=nomenclature


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